RNA 測(cè)序 (RNA-seq) 是一項(xiàng)革命性技術(shù)，改變了基因組學(xué)領(lǐng)域。它為研究人員揭示細(xì)胞和分子水平上發(fā)生的許多復(fù)雜過(guò)程開(kāi)辟了新途徑。與 DNA 測(cè)序不同，RNA-seq 通過(guò)提供任何給定時(shí)間所有活性基因的快照來(lái)深入了解基因組的功能元件。那么，這如何幫助用戶對(duì)不同的細(xì)胞類(lèi)型進(jìn)行分類(lèi)呢？請(qǐng)繼續(xù)閱讀以了解更多信息。

RNA 測(cè)序在細(xì)胞類(lèi)型分類(lèi)中的威力

RNA 測(cè)序已成為細(xì)胞類(lèi)型分類(lèi)的強(qiáng)大工具。它使科學(xué)家能夠識(shí)別特定的細(xì)胞類(lèi)型并了解它們?cè)诟鞣N生物過(guò)程中的作用。這是因?yàn)?RNA-seq 能夠分析單個(gè)細(xì)胞中的基因表達(dá)水平。許多研究領(lǐng)域都將從這種開(kāi)創(chuàng)性的方法中受益，但它在研究肺纖維化等疾病方面已經(jīng)顯示出非凡的潛力，在這些疾病中，不同細(xì)胞群的作用尚未全了解。

單細(xì)胞 RNA 測(cè)序：游戲規(guī)則改變者

單細(xì)胞 RNA 測(cè)序 (scRNA-seq) 將 RNA 測(cè)序提升到一個(gè)新水平。它使科學(xué)家能夠分析單個(gè)細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組，提供細(xì)胞類(lèi)型和狀態(tài)的高分辨率視圖。與傳統(tǒng)的 RNA 測(cè)序方法相比，這是一個(gè)重大進(jìn)步，傳統(tǒng)的 RNA 測(cè)序方法提供大量細(xì)胞的平均基因表達(dá)譜。

在最近一項(xiàng)題為“單細(xì)胞 RNA 測(cè)序揭示肺纖維化中不同上皮和間質(zhì)譜系的促纖維化作用"的研究中，scRNA-seq 被用來(lái)揭示肺纖維化的復(fù)雜細(xì)胞景觀。該研究使用 10x Genomics Chromium 平臺(tái)進(jìn)行單細(xì)胞 RNA 測(cè)序，該平臺(tái)生成乳液中的單細(xì)胞凝膠珠 (GEM)，用于逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程以創(chuàng)建 cDNA。然后對(duì)該 cDNA 進(jìn)行擴(kuò)增并用于測(cè)序。

DeNovix 在 RNA 測(cè)序中的作用

DeNovix DS-11 FX+ 分光光度計(jì)/熒光計(jì)在這項(xiàng)研究中發(fā)揮了至關(guān)重要的作用。該儀器用于定量 RNA，這是 RNA 測(cè)序過(guò)程中的關(guān)鍵步驟。RNA的定量確保了測(cè)序過(guò)程有足夠的材料，并有助于保證樣品的質(zhì)量。這是 10x Genomics 平臺(tái)單細(xì)胞 RNA 測(cè)序的準(zhǔn)備步驟。

細(xì)胞計(jì)數(shù)是 RNA 測(cè)序的另一個(gè)重要準(zhǔn)備步驟。在一項(xiàng)相關(guān)研究“模擬人類(lèi)肺細(xì)胞暴露于野火中發(fā)現(xiàn)異常的 lncRNA 特征"中，DeNovix CellDrop™ 系統(tǒng)用于在 0.4% 臺(tái)盼藍(lán) 1:1 稀釋液中對(duì)人類(lèi)永生化支氣管氣管細(xì)胞 (AALE) 進(jìn)行計(jì)數(shù)，并在其死亡前 24 小時(shí)進(jìn)行計(jì)數(shù)。直接煙霧暴露（DSE）。暴露于氣液界面 (ALI) 室后，細(xì)胞用于 RNA 測(cè)序分析，以識(shí)別 IncRNA 的變化。結(jié)果表明煙霧成分對(duì)于野火煙霧的分子效應(yīng)的重要性。具體來(lái)說(shuō)： 

“我們的結(jié)果闡明了化學(xué)成分（以及地理來(lái)源）在評(píng)估野火煙霧暴露可能導(dǎo)致的呼吸系統(tǒng)健康風(fēng)險(xiǎn)方面的重要性。我們使用通過(guò)實(shí)驗(yàn)生成的 RNA-seq 數(shù)據(jù)進(jìn)行公正的分析，旨在識(shí)別差異表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本，在這里，通過(guò)嚴(yán)格和全局的分析，我們證明不同的野火煙霧會(huì)誘導(dǎo) lncRNA 的異常表達(dá)。"

機(jī)器學(xué)習(xí)和 RNA 測(cè)序

機(jī)器學(xué)習(xí)是另一種越來(lái)越多地與 RNA 測(cè)序結(jié)合使用的工具。通過(guò)訓(xùn)練已知細(xì)胞類(lèi)型的數(shù)據(jù)，機(jī)器學(xué)習(xí)算法可以根據(jù)細(xì)胞類(lèi)型的基因表達(dá)譜對(duì)細(xì)胞類(lèi)型進(jìn)行分類(lèi)。這可以大大提高細(xì)胞類(lèi)型分類(lèi)的準(zhǔn)確性和效率。

RNA測(cè)序的應(yīng)用

RNA-seq 的應(yīng)用廣泛且多樣。從了解疾病中細(xì)胞群的復(fù)雜性到發(fā)現(xiàn)選擇性剪接變體，RNA-seq 是現(xiàn)代基因組學(xué)庫(kù)中的多功能工具。

RNA 測(cè)序的未來(lái)

隨著新技術(shù)和方法的不斷開(kāi)發(fā)，RNA測(cè)序的未來(lái)是光明的。對(duì)不同 RNA 分子及其表達(dá)水平的研究不斷增長(zhǎng)，這將與 RNA-seq 的進(jìn)步契合，并擴(kuò)大我們可以理解的細(xì)胞類(lèi)型的數(shù)量。 

在 DeNovix，我們很自豪能夠成為這個(gè)令人興奮的領(lǐng)域的一部分。我們邀請(qǐng)您探索我們的產(chǎn)品和服務(wù)范圍，并與我們一起突破 RNA 測(cè)序的可能界限。使用我們的組合分光光度計(jì)/熒光計(jì)和開(kāi)創(chuàng)性的自動(dòng)細(xì)胞計(jì)數(shù)器，用戶可以優(yōu)化 RNA 測(cè)序的準(zhǔn)備步驟，以保證最高的質(zhì)量。我們可以一起繼續(xù)解開(kāi)細(xì)胞的秘密，并在分子水平上增進(jìn)我們對(duì)生命的理解。